O Mestrado Profissional em Educação Profissional em Saúde tem por objetivo o aprofundamento do conhecimento técnico e acadêmico, possibilitando a formação de docentes para o ensino superior e para a pós-graduação lato sensu, bem como o desenvolvimento de habilidades para realizar pesquisas e desenvolver processos, produtos e metodologias em áreas específicas. O curso é voltado a professores e outros profissionais que atuam ou se interessam por Educação Profissional em Saúde, segmento que engloba a formação de trabalhadores de nível auxiliar e técnico. O curso tem a duração de dois anos e inclui disciplinas como 'Política de educação e de saúde', 'Economia da educação e concepções de formação em saúde', 'Educação profissional no Brasil: contextos e questões atuais', 'Educação do adulto trabalhador' e 'Historicidade da educação dos trabalhadores em saúde'.